Il Comune di Brugine è situato a circa 17 chilometri a sud da Padova, sulla strada verso Piove di Sacco (comune con il quale confina ad est), in una zona fertile ricca di campi, sebbene lambita dal corso di due soli piccoli fiumi (escluso il Bacchiglione che scorre più a sud) il Fiumicello e la Schilla.
Il Comune di Brugine confina, oltre che con Piove di Sacco, con altri cinque comuni, tutti appartenenti alla provincia di Padova: a nord con Legnaro e Sant’Angelo di Piove di Sacco, ad ovest e a sud-ovest con Bovolenta e Polverara, e a sud con Pontelongo.